Acho que o teu problema com as algas deriva do facto de teres a circulação mal ajustada...
Tens apenas uma bomba apontada ao aquario e o que está a acontecer, no meu ponto de vista, é que estás a criar zonas mortas de corrente o que origina a acumulação das algas nessas mesmas zonas.
O meu conselho será para comprares uma outra bomba e tentares fazer com que as correntes choquem, e originares turbilhoes de circulação. Acabas com as zonas mortas, e originas todo um novo fluxo de água (sem deixar que as algas se acumulem nessas zonas mortas).
O resto já sabes

Abraço e boa sorte!