Pela descrição deves ter um problema com cianos. Verifica a circulação e vê se não tens zonas "mortas". Tambem podes usar algo deste genero para evitar que cubram os corais: http://www.fragariodonorte.com/?id=4&cid=24&pid=1008
confirma os fosfatos pois podes estar com valores elevados.
Não stresses!